讲述了记者赖川浩司调查地球异常气象时，发现外星机械兽母舰“雾母”企图灭绝人类。浩司因好友木村加奈被选为祭品而遭杀害，后被地底使者改造为假面骑士J，并注入“J Power”力量。他接连对抗雾母麾下的三干部（卡赖、亚基度、亚魅）。该片是石森章太郎参与的最后一部假面骑士作品，首次引入骑士巨大化设定引发热议。